Começou a fazer cinema em 1975.
Em parceria Óscar Alves, logo após a Revolução de Abril, fundou a Cineground, uma produtora que se caracterizou por fazer uma primeira tentativa de comercialização de filmes Super 8, em pequenas salas de diversão (“boîtes” e clubes nocturnos), em Portugal. Esses seriam aliás os lugares de eleição, na época, para a divulgação de uma cinematografia de carácter underground e, no caso de João Paulo Ferreira, também queer.
Foi ainda membro do Núcleo dos Cineastas Independentes.